卷一--痘原
乾父坤母，化生萬物，獨陽勿克以自生，獨陰勿克以自成，而生物之本系焉。是以男女交媾，亦必二五妙合，而生人之本系焉。（夫二五者，謂陰陽二氣及五行也。）此人生之所自來，而痘之原，亦根於此矣。人皆知其種於淫火之毒，而不知由乎交媾之微，膠稠如脂者，真元之精也，稀清如水者，淫火之液也。痘原之美惡，乃於此分。故人稟清明之氣，修養之純，則真元之精厚，而水火相濟，淫火之液自少，痘之所發必稀疏而順美。人稟淆濁之氣，情慾之雜，則真元之精混，而水火相激，淫火之液自倍，痘之所發必密。比而逆惡，豈俟孕於母腹，而為五辛六疏之物，腥羶煎煿之味，釀成胎毒，傳於男女，結為惡逆之痘乎！李還丹曰：人有七情，而欲之所動，火之使然。蓋欲無火不動，太過即是淫液也。可見痘之為症，本於陽毒，惡烈而莫御，其母胎之毒，不過發為瘡疥丹瘤而已。更有謂兒含胎血致毒者，尤為不經之論耳。
同书章节
- 馮氏錦囊秘錄痘疹全集--凡例
- 卷一--痘原
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- 卷一--雜症勿治
- 卷一--忌食毒物
- 卷一--論痘不可妄汗妄下及宜微汗微下症
- 卷一--虛實
- 卷一--論元氣不可形質拘
- 卷一--四時順逆辨
- 卷一--營衛論
- 卷一--順逆險三法說
- 卷一--五善七惡
- 卷一--禁忌
- 卷一--論避穢氣
- 卷一--治痘觸變歌括
- 卷一--樣痘辨
- 卷一--論痘疹斑疹膿皰先後順逆
- 卷一--八門五樞
- 卷一--三關兩煞五軸
- 卷一--經穴部位諸痘所主
- 卷一--論時日氣血循行略
- 卷一--七日五傳
- 卷一--五臟胎毒所發
- 卷一--紙捻照法
- 卷一--論服藥法並禁解毒藥寒涼
- 卷一--異痘須知
- 卷一--五種痘
- 卷一--異痘諸名
- 卷一--小兒面部見點吉凶之圖說
- 卷一--面部八卦吉凶法
- 卷一--九不識
- 卷一--五禁瘡
- 卷一--總論痘要歌括
- 卷一--馮氏誠求心法
- 卷二--玉函金鎖賦
- 卷二--玄玄賦
- 卷二--辨證賦
- 卷二--碎金賦
- 卷二--論痘出候
- 卷二--論因痘而施治法
- 卷二--論表裡寒熱虛實
- 卷二--形色
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- 卷二--動靜
- 卷二--標本
- 卷二--始終
- 卷二--氣血
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- 卷二--論變黑腰痛
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- 卷二--驗形察色
- 卷二--論虛症補氣不補血
- 卷二--傳變
- 卷二--論輕變重重變輕
- 卷二--論氣虛補瀉
- 卷二--論氣虛血熱補瀉
- 卷二--治血熱壅遏症五法
- 卷二--五臟痘略
- 卷二--虛症似實辨
- 卷二--虛症調護論
- 卷二--痘症決生死期略
- 卷二--論痘當投熱藥辨
- 卷二--脈要
- 卷二--論痘始終順逆險（計十條）
- 卷二--節制賦
- 卷二--權宜賦
- 卷二--指南賦
- 卷二--金鏡賦
- 卷二--玉髓藥性賦
- 卷三（總論痘要夾症門）
- 卷三（總論痘要夾症門）--夾疹
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- 卷三（總論痘要夾症門）--嘔吐噦
- 卷三（總論痘要夾症門）--洩瀉
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- 卷三（總論痘要夾症門）--小便秘澀
- 卷三（總論痘要夾症門）--腹痛
- 卷三（總論痘要夾症門）--不食能食
- 卷三（總論痘要夾症門）--煩躁
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- 卷三（總論痘要夾症門）--論音啞作嗆喉病
- 卷三（總論痘要夾症門）--譫妄
- 卷三（總論痘要夾症門）--寒戰咬牙
- 卷三（總論痘要夾症門）--噯氣噁心
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- 卷三（總論痘要夾症門）--疔（附痘母即賊痘類）
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- 卷三（總論痘要夾症門）--痘爛
- 卷三（總論痘要夾症門）--論痘五不治
- 卷三（總論痘要夾症門）--死症歌括
- 卷三（總論痘要夾症門）--諸候吉凶略
- 卷四（看法諸驗）--論顏色輕重
- 卷四（看法諸驗）--論氣色
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- 卷四（看法諸驗）--驗舌
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- 卷四（看法諸驗）--驗痘要略
- 卷四（看法諸驗）--驗寢寤
- 卷四（看法諸驗）--驗飲食
- 卷四（看法諸驗）--驗諸痛
- 卷四（看法諸驗）--驗四關說
- 卷四（看法諸驗）--痘出約日法
- 卷四（看法諸驗）--驗痘疑似歌括
- 卷四（看法諸驗）--驗痘變症死候
- 卷五（發熱門）--發熱諸論
- 卷五（發熱門）--論氣虛血熱熱毒壅遏症治法三則
- 卷五（發熱門）--論血熱痘症禁忌
- 卷五（發熱門）--論寒熱
- 卷五（發熱門）--辨疑似
- 卷五（發熱門）--錦囊求情論
- 卷五（發熱門）--發熱門雜症（內有未備者，悉其總論痘門參看）
- 卷五（發熱門）--發熱三朝順逆險（碎錦）
- 卷五（發熱門）--發熱證治歌括
- 卷六（見點門）--見點諸論
- 卷六（見點門）--部位
- 卷六（見點門）--袁氏八門
- 卷六（見點門）--驗形察色
- 卷六（見點門）--論氣血交會
- 卷六（見點門）--見點門夾症雜症（內有未備者悉具總論痘要門參看）
- 卷六（見點門）--見點三朝順逆險（碎錦）
- 卷六（見點門）--見點證治歌括
- 卷七（起脹門）--起脹諸論
- 卷七（起脹門）--論黑陷血陷紫陷白陷灰陷及氣血虛實寒熱
- 卷七（起脹門）--論痛
- 卷七（起脹門）--起脹三朝順逆險（碎錦）
- 卷七（起脹門）--起脹證治歌括
- 卷八（灌膿門）--灌膿諸論
- 卷八（灌膿門）--論封蛤
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- 卷九（收靨門）--收靨諸論
- 卷九（收靨門）--論關馘
- 卷九（收靨門）--收靨門雜症變症（內有未備者悉具總論痘要門參看）
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- 卷十--落痂諸論
- 卷十--落痂門雜症（內有未備者悉具總論痘要門參看）
- 卷十--落痂三朝順逆險（碎錦）
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- 卷十一（餘毒門）--餘毒諸論
- 卷十一（餘毒門）--餘毒證治歌括
- 卷十二（婦人科痘瘡）--論女人出痘經至
- 卷十二（婦人科痘瘡）--論女人經後證治並居經症
- 卷十二（婦人科痘瘡）--論經後失音及陷伏
- 卷十二（婦人科痘瘡）--論崩漏出痘
- 卷十二（婦人科痘瘡）--孕婦出痘（附臨產產後）
- 卷十二（婦人科痘瘡）--婦女瘡疹證治歌括
- 卷十三（麻疹門）--麻疹碎金賦
- 卷十三（麻疹門）--金鏡賦
- 卷十三（麻疹門）--論疹與痘治法
- 卷十三（麻疹門）--論諸熱誤治發斑疹
- 卷十三（麻疹門）--論麻疹屬腑治法
- 卷十三（麻疹門）--論疹中咳嗽吐利咽痛口渴
- 卷十三（麻疹門）--論治疹當隨時令不可執用寒涼
- 卷十三（麻疹門）--論疹出宜快並顏色輕重
- 卷十三（麻疹門）--辨疑似
- 卷十三（麻疹門）--辨輕重
- 卷十三（麻疹門）--詳疹諸名
- 卷十三（麻疹門）--奶麻子
- 卷十三（麻疹門）--孕婦出疹
- 卷十三（麻疹門）--論相夾相傳
- 卷十三（麻疹門）--麻疹門雜症
- 卷十三（麻疹門）--麻疹順逆險（碎錦）
- 卷十三（麻疹門）--麻疹證治歌括
- 卷十三（麻疹門）--水痘
- 卷十三（麻疹門）--斑
- 卷十四--彙集古哲治痘諸方
- 卷十四--治痘常用湯散歌括
- 卷十五（痘疹補遺）--驗痘吉凶諸候
- 卷十五（痘疹補遺）--論血熱血盛血虛有異用藥宜涼宜治宜補不同
- 卷十五（痘疹補遺）--錦囊新制治痘用藥活法